In generale, il refactoring è una tecnica per migliorare la progettazione del codice software esistente senza modificarne il funzionamento.

In CODESYS, il refactoring fornisce funzioni per rinominare oggetti e variabili e aggiornare i pin di riferimento. È possibile visualizzare tutte le occorrenze degli oggetti e delle variabili rinominati e rinominarli tutti insieme o singolarmente. In «Tools  Options», si può anche configurare il punto in cui CODESYS richiede il refactoring.